FEDESALUD desde su fundación ha propendido por el desarrollo del conocimiento y la investigación como aporte fundamental al desarrollo sectorial y del país, a través de servicios que deberán ser accesibles para todos los estudiosos del sector, así como para todas las instituciones, bien directamente o a través de medios electrónicos e Internet.

Con este propósito FEDESALUD se encargó de la difusión y comercialización en el país del Sistema de Consulta de Normas Jurídicas sobre Seguridad Social en Salud, editado por Avance Jurídico Casa Editorial Ltda. Este servicio lo hace llegar FEDESALUD a la gran mayoría de hospitales y entidades de salud del país desde el año 2003.

FEDESALUD ha conformado al finalizar 2002 un consorcio con BDO Salud Age de Colombia y BDO Ortega y Asociados de República Dominicana para el desarrollo de sistemas de Auditoría en Salud en República Dominicana, dirigido hacia aseguradores, prestadores e instituciones públicas y privadas.

FEDESALUD en 2003 se asoció con La Colonial Compañía de Seguros S.A., de Santo Domingo, para la creación de una Administradora de Riesgos de Salud en la República Dominicana que inició su operación en el Sistema de Seguridad Social en el segundo semestre de 2008.

Otra fase de investigación y desarrollo es impulsada con el “Proyecto de Gobernabilidad en Salud”, proyecto de investigación – acción que pretende recuperar la gobernabilidad del sector, perdida en el proceso inconcluso de descentralización, a través de la construcción de modelos para la gestión descentralizada de la salud pública en el país.

En Mayo del 2003 el Consejo Directivo de FEDESALUD estableció el premio FEDESALUD a la Gestión Social en Salud, que se otorgará anualmente con el fin de exaltar los logros de las Instituciones y de las personas de cualquiera de las ramas o actividades del sector de la salud y de la seguridad social, que trabajan en pro de garantizar el derecho a la salud de todos los ciudadanos, y cuya gestión sea ejemplo para superar las barreras económicas, culturales, sociales, raciales, de género, por incapacidad o enfermedad, que implican discriminación o exclusión en el derecho a la salud y el acceso a la prestación de servicios, propiciando de esta forma la universalidad y la equidad.

Con motivo del lanzamiento del premio, otorgó los primeros reconocimientos a personas e instituciones destacadas por su gestión social en salud en el 2003, entre ellos la Facultad Nacional de Salud Pública de la Universidad de Antioquia y el Centro de Investigaciones para el Desarrollo de la Universidad Nacional de Colombia.

A finales del 2003 FEDESALUD suscribió un convenio marco con la Universidad de Antioquia con el objeto de establecer las bases de una mutua cooperación entre LA UNIVERSIDAD Y FEDESALUD, a fin de sumar y fortalecer la capacidad de las dos instituciones para la realización de actividades académicas, docentes, investigativas,  y de extensión de servicios en todas aquellas áreas de interés recíproco propios de sus objetivos y funciones, con miras al logro de sus fines y el aprovechamiento racional de sus recursos.

En el año 2004 suscribió igualmente un Convenio marco con la Universidad de Santo Tomás para el desarrollo de la investigación y la docencia en salud y seguridad social. En el desarrollo del convenio marco se protocolizó en 2005 un contrato específico para el Diseño y estructuración de un Programa de Maestría en Seguridad Social, que hará parte de los postgrados de la Universidad en la ciudad de Bogotá.

El Consejo Directivo de FEDESALUD aprobó otorgar el premio en 2005 a la Honorable Corte Constitucional por su permanente y efectiva labor en defensa del derecho a la salud y la seguridad social de los colombianos.

En el año 2007 el Consejo Directivo de FEDESALUD decidió otorgar al periódico EL PULSO – Hospital San Vicente Paúl, de Medellín, el Premio FEDESALUD 2007 a la Gestión Social en Salud, pues este periódico para el sector de la salud, se ha destacado en el ámbito nacional por el análisis y crítica de las políticas de salud y seguridad social, así como por la defensa del derecho a la salud y la seguridad social de los colombianos.

En el año 2010 el Consejo Directivo de la Fundación para la Investigación y Desarrollo de la Salud y la Seguridad Social decidió otorgar el premio FEDESALUD 2010 a la Gestión Social en Salud nuevamente a la Honorable Corte Constitucional, por considerar que los dos últimos fallos trascendentales, la sentencia T-760 de 2008 y la declaratoria de la inexequibilidad de la Emergencia Social decretada por el Gobierno Nacional, hacen de nuevo merecedora de reconocimiento a la HONORABLE CORTE CONSTITUCIONAL

Igualmente otorgó el premio FEDESALUD 2010 a la Gestión Social en Salud a la Empresa Colombiana de Petróleos, dado que esta empresa adoptó un plan responsable para mejorar la calidad de los combustibles en el país y de esta forma solucionar definitivamente el grave problema ambiental y de salud pública de Bogotá y las más importantes ciudades del país.

En 2011 y 2012 FEDESALUD ha participado activamente en las mesas de trabajo organizadas por la Fundación Friedrich Ebert Stiftung en Colombia –FESCOL sobre la problemática del Sistema de Salud.

En el año 2013 el Consejo Directivo de la Fundación para la Investigación y Desarrollo de la Salud y la Seguridad Social decidió otorgar el premio FEDESALUD 2013 a la Gestión Social en Salud, a la Federación Médica Colombiana por su labor a través del Observatorio del Medicamento –Observamed-, especialmente por haber hecho público y denunciado con firmeza el crecimiento exponencial de recobros al FOSYGA, los abusos de aseguradores y prestadores en los precios de recobro, así como la ausencia notoria de regulación y la falta de control la Dirección del Sistema, hechos que ocasionaron un verdadero desangre de los recursos de la salud y pusieron en crisis el financiamiento del Sistema.

El en año 2015 el Consejo Directivo de la Fundación concedió el reconocimiento a los noticieros de televisión Noticias UNO y CM& por haber desarrollado en los últimos años una importante labor en la defensa del derecho a la salud, especialmente por evidenciar reiteradamente las barreras de acceso que enfrentan los colombianos para recibir atención a sus problemas de salud, junto con la ausencia notoria de respuesta efectiva por parte de la Dirección del Sistema ante las quejas ciudadanas. Igualmente otorgó el premio al diario El ESPECTADOR por haber jugado en los últimos años un papel fundamental en debates críticos para la Salud Pública en Colombia (Regulación de medicamentos biológicos, control de precios de medicamentos, Ley Estatutaria, patentes farmacéuticas) y a nivel global (Crisis de la OMS, modelo de innovación farmacéutica, propiedad intelectual), especialmente por la forma oportuna, profunda y juiciosa con la que estos temas han sido investigados y puestos en conocimiento del público especializado y no especializado .

En mayo de 2018, el Colegio Médico de Bogotá y Cundinarmarca y la Federación Médica Colombiana, otorgaron la máxima condecoración que concede el Colegio, la medalla y pergamino Cesar Uribe Piedrahita al Dr. Félix Martínez, Presidente de FEDESALUD, exaltando su labor y sus méritos en defensa de la salud de los colombianos.

En el año 2019 el Consejo Directivo de la Fundación para la Investigación y Desarrollo de la Salud y la Seguridad Social decidió otorgar el premio FEDESALUD 2019 a la Gestión Social en Salud, a la Fundación Ifarma, organización sin ánimo de lucro, que adelanta desde su fundación en el año 2.000 una destacada y valiente labor social en salud, al combatir los engaños y maniobras incluidos en las estrategias de mercadeo y publicidad de la gran industria farmacéutica, defiende los medicamentos genéricos y la política de regulación de precios y encabeza una pelea desigual contra el manejo económico-político e ideológico de la propiedad intelectual en relación con las patentes, las marcas y la protección de datos.

Otorgó igualmente el premio 2019 a la Corporación Colombiana de Padres y Madres RED PAPAZ, entidad sin ánimo de lucro fundada en el 2003 por rectores y presidentes de asociaciones de padres de 34 colegios de Bogotá, porque, en el campo de la salud pública, ha desarrollado la estrategia “No Comas Más Mentiras”, para evitar la exposición de niñas, niños y adolescentes a la publicidad de productos ultra procesados altos en azúcar, sodio y grasas saturadas (comida chatarra) como un paso obligado en la lucha para frenar y disminuir los crecientes índices de sobrepeso y obesidad, así como las enfermedades crónicas derivadas que hoy claramente constituyen el problema de salud más importante del pueblo colombiano.